МОДИФИЦИРОВАННЫЙ ЛЕПТИН С УМЕНЬШЕННОЙ ИММУНОГЕННОСТЬЮ

10-03-2005 дата публикации
Номер:
RU2003125638A
Контакты: 101000, Москва, М.Златоустинский пер., 10, кв.15, "ЕВРОМАРКПАТ", И.А.Веселицкой
Номер заявки: 56-12-200338/13
Дата заявки: 05-02-2002



[1]

1. Модифицированная молекула, обладающая биологической активностью белка ожирения человека (лептина) и являющаяся существенно неиммуногенной или менее иммуногенной, чем любая немодифицированная молекула, которая имеет такую же биологическую активность при использовании in vivo.

[2]

2. Молекула по пункту 1, в которой указанная потеря иммуногенности достигается путем удаления одного или более эпитопов Т-клеток, имеющих происхождение от исходной немодифицированной молекулы.

[3]

3. Молекула по пункту 1 или 2, в которой указанная потеря иммуногенности достигается путем уменьшения числа аллотипов МНС (основного комплекса гистосовместимости), способных связывать пептиды, имеющие происхождение от указанной молекулы.

[4]

4. Молекула по пункту 2 или 3, в которой удален один эпитоп Т-клеток.

[5]

5. Молекула по одному из пунктов 2-4, в которой указанные изначально присутствующие эпитопы Т-клеток являются лигандами класса II МНС или пептидных последовательностей, которые демонстрируют способность стимулировать или связывать Т-клетки через презентацию на классе II.

[6]

6. Молекула по пункту 5, в которой указанные пептидные последовательности выбраны из группы как представлено в таблице 1.

[7]

7. Молекула по любому из пунктов 2-6, в которой 1-9 аминокислотных остатков в любом из исходно присутствующих эпитопов Т-клеток изменены.

[8]

8. Молекула по пункту 7, в которой один аминокислотный остаток изменен.

[9]

9. Молекула по пункту 7 или 8, в которой изменение аминокислотных остатков представляет собой замену исходно присутствующей(их) аминокислоты(от) другим(ими) аминокислотным(ыми) остатком(ами) в специфическом положении(ях).

[10]

10. Молекула по пункту 9, в которой одна или более аминокислотных замен выполнены так, как показано в таблице 2.

[11]

11. Молекула по пункту 10, в которой дополнительно одна или более аминокислотных замен выполнены так, как показано в таблице 3, для уменьшения числа аллотипов МНС, способных связывать пептиды, имеющие происхождение от указанной молекулы.

[12]

12. Молекула по пункту 9, в которой одна или более аминокислотных замен выполнены так, как показано в таблице 3.

[13]

13. Молекула по пункту 7 или 8, в которой изменение аминокислотных остатков представляет собой делецию исходно присутствующего(их) амикислотного(ых) остатка(ов) в специфическом положении(ях).

[14]

14. Молекула по пункту 7 или 8, в которой изменение аминокислотных остатков представляет собой добавление аминокислоты(от) в специфическом положении(ях) к тем, что изначально присутствуют.

[15]

15. Молекула по любому из пунктов 7-14, в которой также дополнительно создают изменение для того, чтобы восстановить биологическую активность указанной молекулы.

[16]

16. Молекула по пункту 15, в которой дополнительные изменения представляют собой замену, добавление или делецию специфической аминокислоты(от).

[17]

17. Модифицированная молекула по любому из пунктов 7-16, в которой изменение аминокислоты делают в соответствии с гомологичной белковой последовательностью.

[18]

18. Модифицированная молекула по любому из пунктов 7-16, в которой изменение аминокислоты делают в соответствии со способами моделирования in silico.

[19]

19. Последовательность ДНК, кодирующая модифицированный лептин по любому из пунктов 1-18.

[20]

20. Фармацевтическая композиция, содержащая модифицированную молекулу, обладающую биологической активностью лептина, как определено в любом из приведенных выше пунктов, необязательно вместе с фармацевтически приемлемым носителем, разбавителем или наполнителем.

[21]

21. Способ производства модифицированной молекулы, обладающей биологической активностью лептина, как определено в любом из приведенных выше пунктов, который включает следующие стадии:

[22]

(i) определение аминокислотной последовательности полипептида или его части;

[23]

(ii) идентификацию одного или более потенциальных эпитопов Т-клеток в пределах аминокислотной последовательности белка с помощью любого метода, предполагающего определение связывания пептидов с молекулами МНС при использовании способов in vitro или in silico или биологических анализов;

[24]

(iii) конструирование вариантов с новыми последовательностями с одной или более аминокислотами в пределах идентифицированных потенциальных эпитопов Т-клеток, модифицированных таким образом для существенного уменьшения или устранения активности Т-клеточного эпитопа, как определено связыванием пептидов с молекулами МНС при использовании способов in vitro или in silico или биологическими анализами, или путем связывания комплексов пептид-МНС с Т-клетками;

[25]

(iv) конструирование таких вариантов последовательности с помощью способов рекомбинантной ДНК и тестирование таких вариантов для того, чтобы идентифицировать один или более вариантов с желаемыми свойствами; и

[26]

(v) необязательное повторение стадий (ii)-(iv).

[27]

22. Способ по пункту 21, в котором стадию (iii) выполняют путем замены, прибавления или делеции 1-9 аминокислотных остатков в любом из первоначально присутствующих эпитопов Т-клеток.

[28]

23. Способ по пункту 22, в котором изменение сделано касательно гомологичной белковой последовательности и/или моделирующего способа in silico.

[29]

24. Способ по любому из пунктов 21-23, в котором стадию (ii) выполняют с помощью следующих этапов: (а) отбора участка пептида, имеющего известную последовательность аминокислотных остатков; (b) последовательного отбора аминокислотных сегментов перекрывающихся участков с предварительно определенным одинаковым размером и состоящих, по крайней мере, из трех аминокислотных остатков выбранного участка; (с) подсчет значения связывания молекулы класса II МНС для каждого выборочного сегмента путем суммирования определенных значений для каждой гидрофобной аминокислотной боковой цепи, которая присутствует в каждом дискретном сегменте аминокислотных остатков; и (d) идентификацию, по крайней мере, одного из указанных сегментов, основываясь на подсчитанной величине связывания молекулы класса II МНС для этого сегмента для изменения общего значения связывания МНС класса II для пептида, без существенного уменьшения терапевтической полезности пептида.

[30]

25. Способ по пункту 24, в котором этап (с) выполняют при использовании счетной функции Bohm, модифицированной для включения 12-6 лиганд-протеиновой энергии отталкивания Ван-дер-Ваальса и лиганд-конформационной энергии путем (1) обеспечения первой базы данных моделей молекулы класса II МНС; (2) обеспечения второй базы данных возможного пептидного скелета для моделей молекул указанного класса II МНС; (3) отбора модели из указанной первой базы данных; (4) отбора возможного пептидного скелета из второй базы данных; (5) идентификации боковых цепей аминокислотных остатков, которые присутствуют в каждом выборочном сегменте; (6) определения значения связывающего сродства для всех боковых цепей, которые присутствуют в каждом выборочном сегменте; и повторение этапов от (1) до (5) для каждой указанной модели и каждого указанного скелета.

[31]

26. Тринадцатимерный пептид эпитопа Т-клеток, имеющий потенциальную связывающую активность класса II МНС и созданный из немодифицированного лептина, выбранный из группы, как показано в таблице 1.

[32]

27. Пептидная последовательность, состоящая, по крайней мере, из 9 соприкасающихся аминокислотных остатков тринадцатимерного пептида эпитопа Т-клеток по пункту 26.

[33]

28. Применение тринадцатимерного пептидного эпитопа Т-клеток в соответствии с пунктом 26 для производства лептина, который существенно не имеет иммуногенности или имеет меньшую иммуногенность, чем немодифицированная молекула с той же биологической активностью, при использовании in vivo.

[34]

29. Применение пептидной последовательности по пункту 27 для производства лептина, который существенно не имеет иммуногенности или имеет меньшую иммуногенность, чем немодифицированная молекула с той же биологической активностью, при использовании in vivo.